デフォルトファイルマネージャーがvlcになってしまった。

 $ xdg-mime query filetype $HOME
inode/directory

$ xdg-mime query default inode/directory
vlc.desktop

$ xdg-mime default pcmanfm-qt.desktop inode/directory

（デフォルトファイルマネージャーをpcmanfm-qtに変える）

$ xdg-mime query default inode/directory
pcmanfm-qt.desktop